Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms