Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms