Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms