Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms