Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc94Q9D6J3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc94Q9D6J3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc94Q9D6J3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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