Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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