Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rsph14Q9D3W1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rsph14Q9D3W1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rsph14Q9D3W1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rsph14Q9D3W1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rsph14Q9D3W1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rsph14Q9D3W1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rsph14Q9D3W1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rsph14Q9D3W1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rsph14Q9D3W1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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