Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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