Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms