Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms