Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa9Q9CZN4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms