Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx7Q9CY18 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx7Q9CY18 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx7Q9CY18 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx7Q9CY18 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx7Q9CY18 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.9 ms