Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Khdc3Q9CWU5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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