Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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