Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms