Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms