Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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