Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms