Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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