Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms