Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms