Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms