Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms