Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms