Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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