Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sh3bp5lQ99LH9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms