Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms