Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms