Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms