Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp3Q91W36 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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