Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms