Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms