Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4I3

Arhgef6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, mousemouse

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef6Q8K4I3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Arhgef6Q8K4I3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Arhgef6Q8K4I3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms