Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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