Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo18Q8K2I9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms