Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms