Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY7

Ttc23, Tetratricopeptide repeat protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23Q8CHY7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc23Q8CHY7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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