Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms