Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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