Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms