Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms