Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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