Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms