Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms