Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LnpkQ7TQ95 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LnpkQ7TQ95 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms