Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms