Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GypcQ78HU7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms