Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms