Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms