Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms